前書き
Anacondaは、オープンソースのパッケージマネージャー、環境マネージャー、およびPythonおよびRプログラミング言語のディストリビューションです。 通常、大規模なデータ処理、科学計算、予測分析に使用され、データサイエンティスト、開発者、ビジネスアナリスト、DevOpsで働く人々にサービスを提供します。
Anacondaは720以上のオープンソースパッケージのコレクションを提供し、無料版と有料版の両方で利用できます。 Anacondaディストリビューションには、condaコマンドラインユーティリティが付属しています。 Anaconda Documentation pagesを読むと、アナコンダとcondaについて詳しく知ることができます。
このチュートリアルでは、Ubuntu 16.04サーバーにAnacondaのPython 3バージョンをインストールする方法を説明します。
前提条件
このガイドを始める前に、サーバーにsudo特権を持つ非rootユーザーがセットアップされている必要があります。 Ubuntu 16.04 initial server setup guideを完了することで、これを行う方法を学ぶことができます。
Anacondaのインストール
Anacondaをインストールする最良の方法は、最新のAnacondaインストーラーのbashスクリプトをダウンロードし、検証してから実行することです。
Anaconda Downloads pageでPython3用のAnacondaの最新バージョンを見つけます。 執筆時点では、最新バージョンは5.0.1ですが、利用可能な場合は最新の安定バージョンを使用する必要があります。
次に、サーバーの/tmpディレクトリに移動します。 これは、Anaconda bashスクリプトなどの一時的なアイテムをダウンロードするのに適したディレクトリであり、実行後には必要ありません。
cd /tmpcurlを使用して、AnacondaWebサイトからコピーしたリンクをダウンロードします。
curl -O https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.shこれで、SHA-256チェックサムを介した暗号化ハッシュ検証により、インストーラーのデータ整合性を検証できます。 スクリプトのファイル名とともにsha256sumコマンドを使用します。
sha256sum Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh次のような出力が表示されます。
Output55e4db1919f49c92d5abbf27a4be5986ae157f074bf9f8238963cd4582a4068a Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh適切なAnacondaバージョンのAnaconda with Python 3 on 64-bit Linux pageで利用可能なハッシュに対して出力を確認する必要があります。 出力がsha2561行に表示されるハッシュと一致する限り、問題はありません。
これで、スクリプトを実行できます。
bash Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh次の出力が表示されます。
Output
Welcome to Anaconda3 5.0.1 (by Continuum Analytics, Inc.)
In order to continue the installation process, please review the license
agreement.
Please, press ENTER to continueENTERを押して続行し、ENTERを押してライセンスを読み通します。 ライセンスの読み取りが完了すると、ライセンス条項を承認するよう求められます。
OutputDo you approve the license terms? [yes|no]同意する限り、yesと入力します。
この時点で、インストールの場所を選択するよう求められます。 ENTERを押してデフォルトの場所を受け入れるか、別の場所を指定して変更することができます。
OutputAnaconda3 will now be installed into this location:
/home/sammy/anaconda3
- Press ENTER to confirm the location
- Press CTRL-C to abort the installation
- Or specify a different location below
[/home/sammy/anaconda3] >>>インストールプロセスが続行されます。しばらく時間がかかる場合があります。
完了すると、次の出力が表示されます。
Output...
installation finished.
Do you wish the installer to prepend the Anaconda3 install location
to PATH in your /home/sammy/.bashrc ? [yes|no]
[no] >>>condaコマンドを使用できるように、yesと入力します。 次に、次の出力が表示されます。
OutputPrepending PATH=/home/sammy/anaconda3/bin to PATH in /home/sammy/.bashrc
A backup will be made to: /home/sammy/.bashrc-anaconda3.bak
...インストールをアクティブ化するには、~/.bashrcファイルを入手する必要があります。
source ~/.bashrcそれが済んだら、condaコマンドを使用して、たとえばlistを使用して、インストールを確認できます。
conda listAnacondaのインストールで利用可能なすべてのパッケージの出力を受け取ります。
Output# packages in environment at /home/sammy/anaconda3:
#
_ipyw_jlab_nb_ext_conf 0.1.0 py36he11e457_0
alabaster 0.7.10 py36h306e16b_0
anaconda 5.0.1 py36hd30a520_1
...Anacondaがインストールされたので、Anaconda環境のセットアップに進むことができます。
Anaconda環境のセットアップ
Anaconda仮想環境を使用すると、必要なPythonバージョンとパッケージによってプロジェクトを整理できます。 設定する各Anaconda環境に対して、使用するPythonのバージョンを指定し、関連するすべてのプログラミングファイルをそのディレクトリ内にまとめることができます。
最初に、使用できるPythonのバージョンを確認します。
conda search "^python$"Python 3とPython 2の両方のバージョンを含む、ターゲットにできるさまざまなバージョンのPythonで出力を受け取ります。 このチュートリアルではPython 3でAnacondaを使用しているため、Python 3バージョンのパッケージにのみアクセスできます。
Python 3の最新バージョンを使用して環境を作成しましょう。 これは、バージョン3をpython引数に割り当てることで実現できます。 環境をmy_envと呼びますが、特に環境を使用して複数のバージョンのPythonにアクセスする場合は、環境にわかりやすい名前を使用することをお勧めします。
conda create --name my_env python=3ダウンロードされたものとインストールされるパッケージに関する情報を含む出力を受け取り、yまたはnを続行するように求められます。 同意する限り、yと入力します。
condaユーティリティは、環境のパッケージをフェッチし、完了したときに通知します。
次を入力して、新しい環境をアクティブにできます。
source activate my_env環境をアクティブにすると、コマンドプロンプトのプレフィックスが変更されます。
環境内で、使用する予定のPythonのバージョンを使用していることを確認できます。
python --versionOutputPython 3.6.0 :: Continuum Analytics, Inc.Anaconda環境を無効にする準備ができたら、次のように入力して無効にすることができます。
source deactivate同じ結果を得るには、単語sourceを.に置き換えることができることに注意してください。
Pythonのより具体的なバージョンをターゲットにするには、次のように、3.5のように特定のバージョンをpython引数に渡すことができます。
conda create -n my_env35 python=3.5次のコマンドを使用して、それぞれの環境内で同じブランチに沿ってPythonのバージョンを更新できます（Python 3.5.1をPython 3.5.2に更新する場合など）。
conda update pythonより具体的なバージョンのPythonをターゲットにする場合は、python=3.3.2のように、それをpython引数に渡すことができます。
このコマンドで設定したすべての環境を検査できます。
conda info --envsOutput# conda environments:
#
my_env /home/sammy/anaconda3/envs/my_env
my_env35 /home/sammy/anaconda3/envs/my_env35
root * /home/sammy/anaconda3アスタリスクは、現在アクティブな環境を示します。
conda createで作成する各環境には、いくつかのデフォルトパッケージが付属しています。
-
openssl -
pip -
python -
readline -
setuptools -
sqlite -
tk -
wheel -
xz -
zlib
次のコマンドを使用して、たとえばnumpyなどのパッケージを追加できます。
conda install --name my_env35 numpy作成時にnumpy環境が必要であることがわかっている場合は、conda createコマンドでそれをターゲットにできます。
conda create --name my_env python=3 numpy特定のプロジェクトで作業をしておらず、関連する環境がそれ以上必要ない場合は、削除できます。 これを行うには、次を入力します。
conda remove --name my_env35 --allこれで、conda info --envsコマンドを入力すると、削除した環境が一覧表示されなくなります。
Anacondaの更新
Anacondaが最新であることを定期的に確認して、すべての最新パッケージリリースで作業するようにしてください。
これを行うには、最初にcondaユーティリティを更新する必要があります。
conda update condaプロンプトが表示されたら、yと入力して更新を続行します。
condaの更新が完了したら、Anacondaディストリビューションを更新できます。
conda update anaconda再度、プロンプトが表示されたら、yと入力して続行します。
これにより、condaとAnacondaの最新リリースを使用していることが保証されます。
Anacondaのアンインストール
Anacondaを使用しなくなってアンインストールする必要がある場合は、anaconda-cleanモジュールから開始する必要があります。このモジュールは、Anacondaをアンインストールするときに構成ファイルを削除します。
conda install anaconda-cleanプロンプトが表示されたら、yと入力します。
インストールしたら、次のコマンドを実行できます。 それぞれを削除する前に、yに答えるように求められます。 プロンプトを表示したくない場合は、コマンドの最後に--yesを追加します。
anaconda-cleanこれにより、ホームディレクトリに.anaconda_backupというバックアップフォルダも作成されます。
OutputBackup directory: /home/sammy/.anaconda_backup/2017-01-25T191831次のコマンドを入力して、Anacondaディレクトリ全体を削除できるようになりました。
rm -rf ~/anaconda3最後に、Anacondaが追加した.bashrcファイルからPATH行を削除できます。 そのためには、まずnanoを開きます：
nano ~/.bashrc次に、ファイルの最後までスクロールするか（これが最近のインストールの場合）、CTRL + Wと入力してAnacondaを検索します。 次の行を削除またはコメントアウトします。
/home/sammy/.bashrc
# added by Anaconda3 4.2.0 installer
export PATH="/home/sammy/anaconda3/bin:$PATH"ファイルの編集が完了したら、CTRL + Xと入力して終了し、yと入力して変更を保存します。
これで、Anacondaがサーバーから削除されました。
結論
このチュートリアルでは、Anacondaのインストール、condaコマンドラインユーティリティの操作、環境のセットアップ、Anacondaの更新、および不要になった場合のAnacondaの削除について説明しました。
Anacondaを使用すると、データサイエンス、科学計算、分析、大規模データ処理のワークロードを管理できます。